摘要: 大家好,今天分享一款软件,即可以计算化合物理论同位素分布的软件Isopro 3.0。在做质谱的实验时,特别对合成的化合物进行质量表征时,往往要求ppm绝对值在5以内,对质谱的分辨率要求很高。对于小分子而言Chemdraw能够满足计算需求,但是对于多肽合成的朋友而言,用Chemdraw计算ppm其实是 阅读全文
posted @ 2024-06-30 17:16 皮蛋笔记 阅读(2) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 上篇笔记分享了使用R语言进行GO分析的机械化操作,本篇内容将会分享如何用R语言作通路分析。 紧接上篇笔记内容,作KEGG富集分析用的文件是id.txt文件,即基因ID文件。 1.安装以下所需要的包 install.packages("colorspace") ##安装所需要的包 install.pa 阅读全文
posted @ 2024-06-14 16:22 皮蛋笔记 阅读(238) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: GO分析 基因本体论(Gene Ontology, GO)是一个用于描述基因和基因产品属性的标准术语体系。它提供了一个有组织的方式来a56爆大奖在线娱乐基因在生物体内的各种角色。基因本体论通常从三个层面对基因进行描述:细胞成分(Cellular Component,CC)、生物学过程(Biological Proc 阅读全文
posted @ 2024-06-12 11:12 皮蛋笔记 阅读(189) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 众所周知,在完成蛋白组学组间差异蛋白筛选后,往往要做GO与KEGG功能富集分析,这就需要a56爆大奖在线娱乐们首先将蛋白名转换为基因名,或者找出基因ID。将蛋白名转化为基因名可能涉及不同的转换工具或数据库,这里有几种常见的方法: ①UniProt数据库:UniProt数据库提供了蛋白和其对应基因的关联信息。可以通过查 阅读全文
posted @ 2024-05-29 21:13 皮蛋笔记 阅读(110) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1.前言 MaxQuant是一款免费的蛋白质组学软件包,由马克斯-普朗克生物化学研究所开发。它内置了自己的搜索引擎Andromeda,可以支持目前主流的蛋白质组学质谱仪厂商产生的原始数据格式。MaxQuant支持标记定量和非标定量,2.0版本后的MaxQuant还支持DIA的数据分析。MaxQuan 阅读全文
posted @ 2024-05-29 13:07 皮蛋笔记 阅读(67) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Linux基础命令 阅读全文
posted @ 2019-08-09 11:35 皮蛋笔记 阅读(194) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Mysql数据库,在主机环境导出导入数据 阅读全文
posted @ 2019-08-09 11:21 皮蛋笔记 阅读(169) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: redis在windows和Linux系统下的下载、安装、配置 阅读全文
posted @ 2019-04-12 23:26 皮蛋笔记 阅读(1322) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Linux系统下zookeeper的安装和配置 阅读全文
posted @ 2019-04-10 23:17 皮蛋笔记 阅读(299) 评论(0) 推荐(0) 编辑