2022年1月27日
深入理解snp-calling流程——转载
摘要： 恢复内容开始 GATK4流程 准备配套数据 明确参考基因组版本！！！b36/b37/hg18/hg19/hg38，记住b37和hg19并不是完全一样的，有些微差别。 1、下载参考基因组 下载地址很多，常用的就是NCBI，ensembl和UCSC，这里推荐用这个脚本下载（下载源为UCSC）： 1 # 阅读全文
posted @ 2022-01-27 16:02 Riven_zrw 阅读(300) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2020年5月26日
echo 操作
摘要： echo打印制表符到文件： MAP_PATH=/path/for i in `cat sp.list`; do echo -e "${MAP_PATH}/${i}.${i}/${i}.final.bam\t250\t${i}" >> config; done 阅读全文
posted @ 2020-05-26 18:26 Riven_zrw 阅读(21) 评论(0) 推荐(0) 编辑