摘要: MindSponge分子动力学模拟——定义一个分子系统(2023.08) a56爆大奖在线娱乐通过解析MindSponge的源码实现,详细介绍了在MindSponge中Molecule基础分子类的内置属性和内置函数,以及三种相应的分子系统定义方法:a56爆大奖在线娱乐们既可以使用yaml模板文件来定义一个分子系统,也可以从mol2和pdb文件格式中直接加载一个Molecule,还可以直接使用python列表的形式传入一些手动定义的内容,直接构建一个Molecule。有了最基础的分子系统之后,后面就可以开始定义一些能量项和迭代器,开始分子动力学模拟。 阅读全文
posted @ 2023-08-30 16:53 DECHIN 阅读(317) 评论(0) 推荐(0) 编辑